انتقال‌پذیری نشانگرهای مولکولی SSRسیب، به ژنوتیپ‌های به (Cydonia oblonga Mill.)

نویسندگان

چکیده

  بیش از 50 ژنوتیپ و رقم به در کلکسیون ملی کشور جمع‌آوری شده است که اطلاعات مورفولوژیک و ژنتیکی کمی از آن‌ها در اختیار است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی این ژرم‌پلاسم در مرحله اول اقدام به ارزیابی انتقال‌پذیری توالی‌های تکراری ساده مربوط به گونه سیب، به شماری از ژنوتیپ‌های به کشور شد. برای این منظور DNA سیزده ژنوتیپ به استان اصفهان همراه با رقم تجارتی «اصفهان» با روش‌های CTAB تغییر یافته، SDS تغییر یافته و ادغام دو روش CTAB و SDS استخراج و بهترین کیفیت DNA از روش اخیر حاصل شد. DNA این مواد با استفاده از هشت جفت آغازگر SSR سیب شامل CH05d04 ، CH02b10 ، CH02d08 ، CH03g06 ، CH02h11a ، CH04e03 ، CH04a12 و NZ02b01 تکثیر شد. هفت جفت از آغازگرهای مورد استفاده قادر به تکثیر 33 مکان ژنی توالی‌های تکراری ساده ژرم‌پلاسم به مورد ارزیابی بودند، که از این تعداد شش جفت آغازگر تنوع ژنتیکی نشان دادند. جفت آغازگر CH03g06 قادر به تکثیر بیشترین آلل بود و بالاترین شاخص اطلاعاتی پلی‌مورفیسم را نشان داد، در حالی که جفت آغازگر NZ02b01 هیچ قطعه‌ای را تکثیر نکرد . براساس الگوی باندی تولیدی، ژنوتیپ‌های به استان اصفهان در هشت کلاستر به ترتیب دربردارنده 1، 2، 1، 3، 2 ، 2، 1 و 1 ژنوتیپ طبقه‌بندی شدند و به نظر می‌رسد دو ژنوتیپ SHA1 و SVS2 یکسان باشند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Transferability of Apple Derived SSR Markers to Genotypes of

نویسندگان [English]

  • M. Khoramdel Azad
  • H. Abdollahi
  • A. Ghasemi
  • S. Hajmansoor
چکیده [English]

More than 50 quince genotypes have been collected in national quince collection that a few morphological and genetical information are available now on these genotypes. In order to study the genetical basis of diversity in this collection, current research was conducted, principally aimed at evaluation of the transferability of some apple SSRs to some quince genotypes. The DNA of 13 quince genotypes, as well as DNA of cultivar "Isfahan" were extracted using modified CTAB, modified SDS and a combined CTAB, SDS methods, that last method resulted in the best quality of extracted DNAs. Quince DNAs were amplified with eight primer sets of apple SSR including CH05d04, CH02b10, CH02d08, CH03g06, CH02h11a, CH04e03, CH04a12 and NZ02b01. Seven pairs out of eight primer pairs amplified a totally 33 SSR loci, that six pairs demonstrated the genetic variation of tested quince genotypes. CH03g06 was able to amplify the highest allelic number as well as resulting the highest index of polymorphism information content. The tested quince genotypes were clustered in eight categories, consisted of 1, 2, 1, 3, 2, 2, 1 and 1 genotypes. In the 6th group two genotypes SHA1 and SVS2 seemed to be synonyms.   

کلیدواژه‌ها [English]

  • Quince
  • Cydonia oblonga
  • SSR marker
  • Transferability
  • Apple
  • Polymorphism