تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های جو (vulgare Hordeum) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره و تجزیه ارتباط صفات وابسته به سازگاری به خشکی

نویسندگان

1 گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل

2 موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور، مراغه

چکیده

این مطالعه به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی و گروه ‌بندی 52 ژنوتیپ جو زراعت دیم متعلق به کشورهای مصر، ایران و چین (تهیه شده از مؤسسه تحقیقات کشاورزی دیم، مراغه) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انجام شد. پس از استخراج DNA از برگ‌های جوان، محصولات تکثیری با استفاده از 59 جفت آغازگر ریزماهواره روی ژل الکتروفورز واسرشته‌ساز پلی‌آکریلامید 5/4% تفکیک شدند. در کل از 40 جفت آغازگر ریزماهواره دارای تکثیر مناسب 134 الل چندشکل، با میانگین 4/3 الل به ازای هر نشانگر شناسایی شد و متوسط PIC برای کلیه نشانگرها 47/0 محاسبه شد. براساس نتایج، نشانگرهای ریزماهواره چندشکلی بالایی در ژنوتیپ‌های جو نشان دادند. در تجزیه خوشه‌ای به روش UPGMA ژنوتیپ‌ها به دو گروه اصلی طبقه‌بندی و ژنوتیپ‌های دو ردیفه و شش ردیفه تا حد زیادی از هم تفکیک شدند. تنوع ژنتیکی مطلوبی در درون و بین گروه‌ها وجود داشت. براساس تجزیه ارتباط، 18 نشانگر مثبت سازگاری به خشکی شناسایی شد که در صورت تایید در سایر آزمایش‌ها قابل استفاده در برنامه‌های به‌نژادی هستند. این نشانگرها می‌توانند به‌طور موثر برای ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه ‌بندی ژرم‌پلاسم جو مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic Diversity of Barley (Hordeum vulgare) Genotypes Using Microsatellite Markers and Association Analysis of Traits Related to Drought Compatibility

نویسندگان [English]

  • S. Dezhestan 1
  • M. Izadi Dogonchi 1
  • A. Asghari 1
  • B. Sadeghzadeh 2
چکیده [English]

This study was conducted to investigate the genetic diversity and classification of 52 barley genotypes from Egypt, Iran and China (obtained from Dryland Agricultural Research Institute, Maragheh) using microsatellite markers. DNA was extracted from young barley leaves and amplified PCR products were separated on 4.5% polyacrylamide denaturing gel electrophoresis using 59 microsatellite primer pairs. From 40 microsatellite primer pairs with good amplification, 134 polymorphic alleles were identified with average alleles of 3.4 per marker and the PIC average for all of the markers was calculated 0.47. Based on the results, microsatellite markers showed high polymorphisms in barley genotypes. In cluster analysis based on UPGMA method, genotypes were classified into two main groups and two-rowed and six-rowed genotypes were diverged mostly from each other. Desirable genetic diversity was also detected within and between groups. Based on association analysis, 18 informative markers for drought compatibility were identified, which after confirmation in other tests could be used in breeding programs. In addition, these markers can be used efficiently for assessment of genetic diversity and classification of barley germplasm.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Barley
  • association analysis
  • Genetic diversity
  • Microsatellite markers