مطابقت نتایج فنوتایپینگ و ژنوتایپینگ خود (نا) سازگاری در تعدادی از ارقام و ژنوتیپ‌های سیب ایرانی

نویسندگان

مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج

چکیده

درختان سیب همانند تعدادی دیگر از میوه‌های تیره گلسرخیان خودناسازگارند. سیستم خودناسازگاری در سیب به وسیله یک مکان ژنی با چند آلل کنترل می‌شود. در این تحقیق نتایج به دست آمده از مطالعه درصد تشکیل میوه پس از خودگرده‌افشانی بر تعدادی رقم و ژنوتیپ بومی سیب در بررسی‌های میدانی (باغ) با نتایج به دست آمده از آزمایش‌های ملکولی که به منظور تعیین آلل‌های S انجام شد، مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت . استفاده از یک جفت آغازگر عمومی وجود آلل‌های ناسازگاری را در آن‌ها به خوبی نمایش داد. کاربرد هشت جفت آغازگر اختصاصی، به شناسایی آلل‌های خودناسازگاری در تعدادی از ژنوتیپ‌ها انجامید. نتایج نشان داد ارقام و ژنوتیپ‌ها عموماً دارای آلل‌های S1، S2 و S3 بوده و بین آن‌ها یکی از این آلل‌ها مشترک بود. ارقام نارسیب مشهد و اردبیل 2 دارای آلل‌هایS1، S2، S3 و ژنوتیپ انگلیسی شیراز دارای سه آلل S2، S3، S4 بودند، که احتمال تریپلوئید بودن این ارقام را تقویت می‌کرد. آغازگرهای مورد استفاده در ارقام و ژنوتیپ‌های اردبیل1، گلشاهی، شیشه‌ای تبریز، پاییز مشهد، شیخ احمد، مربایی، گلاب کهنز و آی آر آی4 هیچ آلل ناسازگاری را نشان ندادند که لازم است در مورد آن‌ها از سایر آغازگرهای اختصاصی نیز استفاده شود. ارقام پاییز مشهد، شیخ احمد، مربایی، آی آر آی 1 و آی آر آی 4 در سطح باغ درصدهای پائینی از خودسازگاری را نشان دادند. در بین این ارقام و ژنوتیپ‌ها، آی آر آی 6 با داشتن قدرت بالای تشکیل و نگهداری میوه بالاترین درصد خودسازگاری را داشت.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Conformity of Self- (in) Compatibility Phenotyping and Genotyping Results in some Iranian Apple Cultivars and Genotypes

نویسندگان [English]

  • R. Gharesheikhbayat
  • H. Hajnajari
  • M. Niazi Zeini Vani
  • M. Moradi
چکیده [English]

Apple (Malus domestica Brokh.) as other fruit trees of Rosaceae family is self-incompatible(SI). The apple SI system is controlled by a multi allelic single locus S-locus. In this study, the results of orchard based phenotyping of 25 apple genotypes were compared with the results of on-going S-allele genotyping of them. A more common consensus primer pair, FTQQYQ and FI(D/N)CP(H/R) was able to amplify the S alleles fragments of all samples. Then, using eight pairs of allele specific primers were able to detect S1, S2, S3 and S4 with certain indicating the rather high frequency of these S-alleles in the studied apples. Narsib-e-Mashad, Ardebil2 and also, Englisi-e-Shiraz with three detected S-alleles could be considered as triploids, probably. These primers could not produce any bands for half of the samples leading to apply the remained list of specific primers. Despite of self-incompatibility of apples, some of the cultivars including Payize-e-Mashad, Sheikh Ahmad, Morabbayi, IRI1 and IRI4 showed auto fertility. The genotype IRI6 with highest percentage of fruit set was considerable. According to the results of this research, the PCR based techniques in apple S-genotyping is more useful to recognize cross-compability situation of genotypes.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Apple
  • self-incompatibility
  • S-allele
  • phenotyping
References Hajnajari, H. 2008. Identification of self-compatible cultivars in apple collection(Abstract), Proceedings of the 10th Iranian Genetic Congress, Razi Congress Center, Tehran, Iran (in Persian). Hajnajari, H., and Moradi, M. 2013. Evaluation of self compatibility, pomology, Inbreeding pressure and introducing an auto-fertile apple genotype IRI6. Iranian Journal of Horticultural Sciences 45 (2): 163-174 (in Persian). Halász, J., and Hegedûs, A. 2006. A critical evaluation of methods used for S-genotyping: from trees to DNA level. International Journal of Horticultural Science 12 (2): 19-29. Hegedûs, A. 2006. Review of the sellf-incompatility in apple (Malus domestica Brokh., syn.: Malus pumila Mill.). Horticultural Science 12(2): 31-36. Katoh, N., Goto, K., Asono, J., Fukushima, K., Yamada, K., Kassi, A., Li, T. Z., Takanoha, M., Miyairi, K., and Okuno, T. 2002. S-RNases from self-incompatible and compatible apple cultivars: purification, cloning, enzymic properties, and pollen tube growth inhibitory activity. Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 66 (6): 1185-1195. Matsumoto, S., Kitahara, K., S. Komori, and J, Socjima. 1999a. A new S-allele in apple ‘Sg’ and its similarity to the ‘Sf’ allele from Fuji. HortSciecne 34: 708-710. Matsumoto, S., Kitahara, K., Komori, S., and Socjima, J. 1999b. S-genotypes of 15 apple cultivars and self-compatibility of Megumi, Journal of the Japanese Society for Horticultural Sciecne 68 (2): 236-241. Mirmohammadi Meybodi, A. 2003. Plant Breeding (in Horticulture). University of Isfahan Publications, Isfahan, Iran (in Persian). Moradi, M., 2011. Determination of self compatibility level in selected apple cultivars and comparative pomological investigations of fruit characteristics. MSc. Thesis, College of Agriculture and Natural Resources, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran (in Persian). Nasrabadi, M., Seyfi, A., Ramazanpour S., and Sharifani, M. 2011. Determination of self-incompatibility alleles in Iranian and exotic apples. Proceedings of the 7th Iranian Horticultural Science Congress, 5-8 September, Isfahan, Iran. Nasrallah, J. B., Pei L., Sherman-Broyles, S., Schmidt, R., and Nasrallah, M. E. 2007. Epigenetic mechanisms for breakdown of self-incompatibility in interspecific hybrids. Genetics 175 (4): 1965-1973. Satio, A., Tomoko Fukasawa, A., Megumi, I., Sato, T., and Masahiko, S. 2007. Self-compatibility of 3 Apple cultivars and identification of S-allele genotypes in their self-pollinated progenies. Horticultural Research (Japan) 6 (1): 27-32.