تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی بین ارقام بادام ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره (SSR)

نویسندگان

مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی چهارمحال و بختیاری، شهر کرد

چکیده

در این پژوهش تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی بین 53 رقم بادام ایرانی و خارجی با استفاده از پانزده مکان ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 131 آلل با دامنه اندازه باند بین 75 تا 205 جفت باز و تعداد 4 تا 13 آلل با میانگین آللی 73/8 و میانگین آلل های موثر 92/5 در هر مکان مشاهده شد. هتروزیگوسیتی مورد انتظار بین 63/0 تا 92/0 با میانگین 81/0 در هر مکان متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی و قدرت تفکیک کنندگی به ترتیب 81/0 و 77/0 بود. هتروزیگوسیتی بالایی بین ارقام وجود داشت و دامنه تغییرات آن از کم (2/0) تا زیاد (73/0) متغیر بود. بین ارقام مورد مطالعه، تنوع بالا و میزان تشابه مختلفی از کم (039/0) تا خیلی زیاد (96/0) وجود داشت. نتایج تجزیه خوشه‌ای با استفاده از ضریب تشابه دایس به روش UPGMA ارقام بادام را به 8 گروه اصلی تقسیم کرد که بیانگر تنوع بالایی را بین ارقام بادام بود، اما در برخی موارد تشابه ژنتیکی بالایی بین برخی ارقام ایرانی و خارجی دیده شد. تنوع بالای بین ارقام بادام ایرانی بیانگر منبع غنی ژرم‌پلاسم بادام ایران برای استفاده در برنامه‌های به نژادی بادام است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic Diversity and Relationship of Iranian and Exotic Almond Cultivars Using Microsatellite (SSR) Markers

نویسندگان [English]

  • S. A. Mousavi
  • M. R. Fattahi Moghaddam
  • Z. Zamani
  • M. Tatari
  • A. Imani
  • P. Martinez-Gomez
چکیده [English]

Genetic diversity and relationships among 53 almond cultivars from Iran and foreign countries were evaluated using fifteen microsatellite (SSR) loci. Totally 131 alleles were observed with size ranking between 75 to 205bp and 4 to 13 alleles with an average 8.73 alleles and 5.92 effective alleles per locus. Expected heterozygosity varied between 0.63 and 0.92 with an average of 0.81 per locus. Average PIC and PD were 0.81 and 0.77, respectively. The results revealed high level of heterozygosity in almond accessions, with variable range from low (0.2) to high (0.73). There were high variability and different similarity from low (0.039) to high (0.96) among the almond accessions. Results of cluster analysis using UPGMA algorithm based on Dice similarity coefficient categorized cultivars in eight main groups indicating high levels of genetic diversity among the almond cultivars, however, in some cases high similarities were found among some Iranian and foreign cultivars. The great diversity among Iranian almond cultivars shows a rich source of almond germplasm which can be used in breeding programs.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Almond
  • Accessions
  • molecular markers
  • Genetic diversity
  • cluster analysis