جداسازی و ارزیابی تنوع ژن‌های وابسته به بیماری‌زایی (PR) تعدادی از گونه‌های درختان میوه دانه‌دار

نویسندگان

چکیده

به دلیل پیچیدگی روابط گیاه با عوامل بیماری‌زا، شناخت ساختارهای ژنتیکی مقاومت گیاه در مقابل این عوامل از جمله ژن‌های مرتبط با بیماری‌زایی (PR Genes) از اهمیت بالایی برخوردار است. این تحقیق با هدف جداسازی و ارزیابی تنوع این ژن‌ها در ژنوتیپ‌های سیب (Malus×domestica)، گلابی معمولی (Pyrus communis)،‌ گلابی برگ‌بیدی (P. salicifolia) و به (Cydonia oblonga) انجام شد. طراحی آغازگرهای اختصاصی و نیمه اختصاصی روی نواحی حفاظت شده ژن‌های PR1a، PR3-Ch1، PR3-Ch2، PR3-Ch3، PR3-Ch5، PR5 وPR8 از گونه‌های دولپه‌های نزدیک انجام و روی DNA استخراج شده با استفاده از روش تلفیقی CTAB-SDS ارزیابی شد. تعداد ژنوتیپ مورد بررسی در گونه سیب، گلابی اروپایی، گلابی برگ‌بیدی و به ترتیب 7، 7، 1 و 12 عدد بود. پس از بهینه‌سازی شرایط دمایی و غلظتی واکنش PCR مربوط به هر جفت آغازگر، مشخص شد که امکان انتقال‌پذیری جفت آغازگرهای طراحی شده به درختان میوه دانه‌دار در مورد اغلب ژن‌های PR مورد نظر وجود داشت. بر اساس نتایج بررسی هومولوژی برای اولین بار ژن‌های PR1a،PR3-Ch1 ، PR3-Ch3، PR3-Ch5 ، PR5 و PR8 در برخی ارقام بومی و یا وارداتی سیب، ارقام گلابی و به و ژنPR3-Ch4 در سیب و گلابی جداسازی و پس از تعیین توالی در بانک اطلاعاتی به ودیعه گذاشته شدند. بررسی میزان تنوع ژنتیکی ژن‌های جداسازی شده با استفاده از توالی‌یابی نشان داد که ژن‌های حاصل با وجود موتاسیون‌های نقطه‌ای، از هومولوژی نسبتاً بالایی در بین گونه‌های درختان میوه دانه‌دار برخوردارند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Isolation and Evaluation of Variation in Pathogenesis Related (PR) Genes of some Pome Fruit Species

نویسندگان [English]

  • M. Hassani
  • H. Abdollahi
  • M. Khosrowshahli
  • S. Torabi
  • S. Hajmansoor
  • Y. Madadkari
چکیده [English]

Due to complexity of plant responces to the pathogens, recognition of resistance systems including behaviour of PR genes is an important aspect in this interaction. This research was conducted to isolate and evaluate diversity of some PR genes in genotypes of apple (Malus×domestica), pear (Pyrus communis), willow-leaved pear (P. salicifolia) and quince (Cydonia oblonga) species. Primer design was achieved on PR1a, PR3-Ch1, PR3-Ch2, PR3-Ch3, PR3-Ch5, PR5 and PR8 genes using sequences of genetically related dicotyledon and DNA extraction performed using a CTAB-SDS combine method. Number of evaluated apple, pear, willow-leaved pear and quince genotypes were 7, 7, 1 and 12, respectively. Following optimization of the thermal profile and concentration of the PCR component reaction, significant transferibility of PR genes primers were observed among tested pome species. According to the homology search, PR1a, PR3-Ch1, PR3-Ch3, PR3-Ch5, PR5 and PR8 genes were isolated and reported in some indigenous or exogenous apple cultivars, as well as in pear and quince cultivars. in addition, PR3-Ch4 gene was isolated in apple and pear and deposited in data bank. Comparison of the genetic diversity of the isolated genes by using DNA sequencing method indicated high level of homology despite existance of some minor point mutations in nucleotid sequences of various pome species.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Pathogenesis related genes
  • Genetic diversity
  • Sequencing
  • Apple
  • Pear
  • Quince