گروه‌بندی عناب‌های ایران بر اساس صفات کمی و نشانگرهای ISSR و RAPD

نویسندگان

چکیده

عناب (Zizyphus jujuba Mill.) یکی از گیاهان باغی مهم با گونه‌ها و واریته‌های متنوع در منطقه آسیای مرکزی و غربی است که در بسیاری از مناطق و استان‌های ایران پراکنش طبیعی دارد. این تحقیق با هدف بررسی تنوع ژنتیکی و ژنومی با استفاده از صفات کمی و مارکرهای مولکولی ISSR و RAPD در کلکسیون عناب ایران، شامل نمونه‌های جمع‌آوری شده از هشت استان، در استان خراسان جنوبی انجام شد. تنوع قابل ملاحظه‌ای در میان 29 اکوتیپ مورد بررسی با کمک مارکرهای یاد شده به دست آمد. از میان سیزده پرایمر ISSR استفاده شده، شش پرایمر از جمله (AC)8YT و (GA)8 A انتخاب و 84 مکان باندی به دست آمد که در 83 % مورد، پلی‌مورفیسم مناسبی مشاهده شد. از میان پانزده پرایمر تصادفی RAPD استفاده شده، بیش از 80 % پلی‌مورفیسم بین مکان‌های تکثیر شده از شش پرایمر مشاهده شد. بررسی‌های فیلوژنتیکی با استفاده از ژن matK وجود حداقل سه گونه مختلف را در میان اکوتیپ‌های کلکسیون عناب ایران اثبات کرد. نتایج تجزیه خوشه‌ای بر اساس صفات کمی این اکوتیپ‌ها را در سه تا شش گروه اصلی دسته‌بندی کرد. به طور کلی تنوع عناب ایران در سه استان مازندران، اصفهان و خراسان جنوبی یافت شد و خراسان جنوبی تقریباً کل تنوع موجود در ایران را به عنوان یک هسته مرکزی تنوع در بر می‌گیرد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Grouping Jujubes of Iran Based on Quantitative Characteristics and ISSR and RAPD Markers

نویسندگان [English]

  • K. Ghouth
  • S. Malekzadeh Shafaroodi
  • M. H. Rashed Mohassel
  • M. R. Akbari
  • S. H. Razavi
چکیده [English]

Jujube (Zizyphus jujube L.) is an important tree with different species and varieties distributed in the central and west Asian regions as well as in Iran. The present study was performed to investigate the genetic diversity in jujube germplasm of Iran, collected from eight provinces grown in a collection garden in south Khorasan province. The genetic diversity was studied based on quantitative characteristics and ISSR and RAPD molecular markers. The results of molecular analysis showed a considerable genetic variation among 32 studied ecotypes. Six efficient primers were selected among 13 ISSR primers e.g. (AC)8YT and (GA) 8A. A total of 84 loci were amplified and 70 (83%) showed proper polymorphism. Among 15 random primers of RAPD markers, more than 80% polymorphism appeared among amplified loci of ecotypes. Phylogenetic analysis using matk gene, indicated existence of at least three different species in Iranian jujube collection. Cluster analysis of quantitative characteristics classified jujube ecotypes into three to six groups. Generally, variation in jujube germplasm could be mainly found in three provinces Mazandaran, Isfahan and South Khorasan, the latter almost covers the total variations.

کلیدواژه‌ها [English]

  • jujube
  • Genetic variability
  • molecular markers
  • Ecotypes