ارزیابی تنوع ژنتیکی توده‌های شنبلیله (Trigonella foenum-graecum) بومی ایران با استفاده از نشانگرهای AFLP

نویسندگان

چکیده

این بررسی به منظورارزیابی تنوع ژنتیکی در بین و درون بیست توده شنبلیله بومی ایران و با انتخاب تصادفی هشت تک بوته(لاین) از هر توده با استفاده از نشانگرهای AFLP انجام شد. استفاده از پنج جفت آغـازگر انتخابی 147 نوار در محدوده 500-50 جفت باز تولید کرد که از این تعداد، 128 نوار (87%) چند شکل بود. محتوای اطلاعات چند شکلی برای هر توده بین 79/0 در توده کاشان(خالص‌ترین توده) تا 93/0 در توده‌های بروجرد و خراسان(ناخالص‌ترین توده‌ها) متغییر بود. نتایج تجزیه واریانس داده‌های مولکولی (AMOVA) نشان داد که، 75% از واریانس کل مربوط به تنوع درون توده‌ای بوده و تنوع ژنتیکی مطلوبی در درون توده‌های مورد مطالعه وجود داشت. دامنه تغییر ضرایب تشابه ژنتیکی بین لاین‌ها از 44% تا 94% بود. همچنین نتایج حاکی از کارآیی مناسب نشانگرهای AFLP در ارزیابی تنوع ژنتیکی شنبلیله بود.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Evaluation of Genetic Diversity in Iranian Fenugreek (Trigonella foenum-graecum) Landraces Using AFLP Markers

نویسندگان [English]

  • D. Sadeghzadeh Ahari
  • M. R. Hassandokht
  • A. K. Kashi
  • A. Amri
چکیده [English]

This study was carried out to assess the genetic diversity among and within twenty Iranian fenugreek landraces (randomly selection of eight single plants from each landrace) using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Five selective primers, produced a total of 147 bands within the molecular weights ranging from 50 to 500 base pairs, of which 128(87%) were polymorphic. Polymorphism information content (PIC) scores ranged from 0.79 for Kashan to 0.93 for Broojerd and Khorasan landraces, indicating that these landraces had the least and the most amount of within population genetic diversity, respectively. Analysis of molecular variations (AMOVA) showed that the diversity within landraces accounted for 75% of the total variations and there was suitable genetic diversity within studied landraces. Genetic similarity coefficients between lines ranged from 44% to 94%. The results also showed high efficiency of AFLP markers for investigation of fenugreek genetic diversity.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Fenugreek
  • Landrace
  • AFLP
  • Genetic variability