تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم انار ترش ایران (Punica granatum L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

نویسندگان

چکیده

در این مطالعه تنوع ژنتیکی 238 ژنوتیپ انار ترش ایران موجود در کلکسیون انار یزد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بررسی شد. تجزیه خوشه‌بندی با روش‌های UPGMA و NJ٬ با استفاده از نرم‌افزار Mega4، و تجزیه ساختار با روش Bayesian با استفاده از نرم‌افزار Structure 2.2 و تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) با نرم‌افزار Ntsys، به منظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت ژنوتیپ‌ها انجام شد. آغازگرهای SSR-MP26 و SSR-MP39 به ترتیب با 907/0 و 544/0 بیشترین و کمترین PIC را نشان دادند. بررسی نتایج تمامی روش‌های ذکر شده نشان داد که طبقه‌بندی ژنوتیپ‌های مورد مطالعه مستقل از منشا جغرافیایی و نام‌گذاری پیشنهادیشان بود. نتایج این بررسی نشان داد که کلکسیون انار یزد ممکن است حاوی ژنوتیپ‌های متفاوت با اسامی مشابه و یا ژنوتیپ‌های یکسان با اسامی متفاوت باشد که ضروری است با تحقیقات بیشتر مورد تایید قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic Diversity of Iranian Sour Pomegranate (Punica granatum L.) Germplasm Based on Microsatellite Markers

نویسندگان [English]

  • M. Kazemi Alamuti
  • M. A. Ebrahimi
  • M. Zeynalabedini
  • M. Mardi
  • T. Roodbar Shojaie
  • M. Pezhman Mehr
  • H. Poor Irandoost
چکیده [English]

In this study, genetic variation of 238 genotypes of Iranian sour pomegranate (Yazd Pomegranate Collection) was studied based on single sequence repeated (SSR) markers. In order to assess the genetic relationships and population structure. Cluster analysis was performed by methods UPGMA and NJ with Mega4 software, structure analysis model-based Bayesian by Structure 2.2 software and principal coordinate analysis (PCoA) with Ntsys software. SSR-MP26 and SSR-MP39 showed the highest (0.907) and lowest (0.544) PIC, respectively. Results of all mentioned methods showed that genotypes are generally clustered independently from their geographical origins and their proposed denomination suggesting that severe admixture in studied samples. These results showed that Yazd pomegranate collection might contain divergent pomegranate genotypes with analogue names or vice versa and needs to be confirmed by future studies.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Pomegranate
  • Genetic variation
  • SSR marker