شناسایی آلل‌های خودناسازگاری شماری از ارقام گلابی بومی ایران

نویسندگان

چکیده

باردهی درخت گلابی (Pyrus communis L.) تحت تاثیر عوامل متعدد ژنتیکی و محیطی قرار می‌گیرد. ارقام گلابی دارای خودناسازگاری گامتوفیتی تحت کنترل مکان ژنی S هستند بنابراین کشت ارقام گرده‌زای مناسب با سازگاری گرده در باغ ضروری است. این تحقیق با هدف شناسایی آلل‌های خودناسازگاری پنج رقم بومی گلابی ایرانی شامل ارقام درگزی، کنجونی، بیروتی، قوسی و آمرود-2 با استفاده از روش PCR انجام شد. بدین منظور DNA ژنومی ارقام استخراج و پس از ارزیابی کمی و کیفی، آلل‌های S آن‌ها با جفت آغازگرهای اختصاصی از پیش طراحی شده Sall-F و Sall-R1 و آغازگرهای طراحی شده با استفاده از خطی کردن آلل‌های S گونه‌های مختلف گلابی، شامل جفت آغازگر FB-F و FB-R1 و جفت آغازگر لانه گزینی شده FB-F و FB-R2 تکثیر شدند. برای تفکیک دقیق آلل‌ها، الگوی نواری قطعات تکثیری پس از هضم با آنزیم‌های برشی DraI، EcoRI، MspI و HaeIII، با الگوی مورد انتظار مقایسه شد. از میان ارقام مورد بررسی، جفت آغازگرهای مورد استفاده توانستند آلل‌های S را در کلیه ارقام تکثیر و مجموعاً شش نوع آلل شامل S1 (Se, Sj) در ارقام قوسی، بیروتی و آمرود-2، S2 (Sl) در رقم درگزی، S4 (Sb) در ارقام بیروتی و درگزی، S5 (Sa) در رقم کنجونی، S13 (St) در رقم قوسی و S42 در رقم کنجونی شناسائی شدند. نتایج نشان‌دهنده حضور آلل نادر S42 متعلق به گونه گلابی یوزوری (Pyrus ussuriensis Maxim.) با منشاء منچوری چین در رقم کنجونی بود که اولین گزارش حاکی از وجود جریان ژنی این گونه در ارقام کشور است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification of Self-Incompatibility Alleles in some Iranian Native Pear Cultivar

نویسندگان [English]

  • F. Babaei
  • H. Abdollahi
  • S. Hajmansoor
چکیده [English]

Bearing of pear trees is affected by various genetical and environmental factors. Pear cultivars are gametophytic self-incompatible that is under control of multi allelic S locus and therefore need to compatible pollinizer cultivars for economical bearing. This research was conducted in order to identify S-alleles of several indigenous pear cultivars including Dargazi, Konjuni, Beyrouti, Ghosi and Amroud-II by PCR techniques. Genomic DNA of plant materials quantitatively and qualitatively were evaluated after extraction. Subsequently, S-alleles were partially amplified by using specific Sall-F/Sall-R1 primers, as well as FB-F/FB-R1 and FB-F/FB-R2 primer pairs designed via alignment of all Pyrus S-alleles. Last primer pairs designed as semi nested for former pair. For pecise identification of S-alleles, amplified regions were restriction digested by selected DraI, EcoRI, MspI and HaeIII enzymes. The primers could amplify all S-alleles in all cultivars and totally 5 alleles including S1(Sj, Se) in Beyrouti, Ghosi and Amroud-II, S2(Sl) in Dargazi, S4(Sb) in Beyrouti and Dargazi, S5(Sa) in Konjouni, S13(St) in Ghosi and S42 in Konjouni were identified. The results demonstrating presence of rare S42 allele from Ussuri pear (Pyrus ussuriensis Maxim.) from Manchuria in China in Konjouni cultivar that is the first report of gene flux of this species in indigenous cultivars.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Key words: Pear
  • self-incompatibility alleles
  • restriction enzyme
  • PCR