تجزیه QTL برای مقاومت به بیماری برق زدگی در نخود زراعی(Cicer arietinum L.) با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره

نویسندگان

چکیده

  امروزه ریزماهواره‌ها، نشانگری منتخب برای تهیه نقشه ملکولی و گزینش به کمک نشانگر برای صفات کلیدی مانند مقاومت به بیماری‌ها در بسیاری از گونه‌های زراعی هستند. در این بررسی به منظور مکان‌یابی QTL ‌های مربوط به اندازه برگ و مقاومت به بیماری برق‌زدگی، Ascochyta rabiei (Pass.) Lab., ، و تعیین سهم هر کدام از QTL ‌ها در تنوع فنوتیپی این صفات، 83 بوته نسل F2 حاصل از تلاقی بین لاین ICC12004 (مقاوم) و نخود محلی بیونیج (حساس) و خانواده‌های F2:3 ، در مرکز بین‌المللی تحقیقات کشاورزی در مناطق خشک (ایکاردا) مورد بررسی قرار گرفتند. نقشه پیوستگی به وسیله 58 نشانگر SSR و یک نشانگر مورفولوژیک (رنگ گل) تهیه شد. از سطح زیر منحنی گسترش بیماری به عنوان معیار سنجش مقاومت به بیماری در نسل‌های F2 و F3 استفاده شد. آزمون فین بر اساس میانگین و واریانس واکنش به برق‌زدگی خانواده‌های F2:3 نشان داد که چند ژن بزرگ اثر در جمعیت در حال تفرّق بوده است. تجزیه پیوستگی نشانگرها را به هشت گروه پیوستگی برابر با تعداد کروموزوم‌های نخود منسوب کرد. در این بررسی بر خلاف نتایج سایر مطالعات، نشانگر رنگ گل در هیچ کدام از گروه‌های پیوستگی قرار نگرفت. نواحی ژنومی و مکان عوامل ژنتیکی مرتبط با اندازه برگ و واکنش در برابر برق‌زدگی، به روش مکان‌یابی فاصله‌ای مرکب مشخص شدند. یک QTL در گروه لینکاژ 7 حدود 15 درصد از تنوع فنوتیپی اندازه برگ را کنترل کرد. از طرف دیگر، سه QTL در گروه‌های لینکاژی 3، 4 و 6 مجموعاً 5/46 در صد از واریانس واکنش به برق‌زدگی را توجیه کردند. با توجه به نتایج حاصل، می‌توان از نشانگرهای تعیین شده برای متمایز کردن ژرم‌پلاسم مقاوم در برنامه‌های اصلاحی آتی استفاده کرد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

QTL Analysis for Ascochyta blight Resistance in

نویسندگان [English]

  • H. Kanouni
  • A. Taleei
  • S. A. Peyghambari
  • S. M. Okhovat
  • M. Baum
  • M. Abang
چکیده [English]

Microsatellites have become markers of choice for molecular mapping and marker assisted selection of key traits such as disease resistance in many crop species. The aim of this study was to construct a genetic linkage map and analyze quantitative trait loci (QTLs) for leaf size and ascochyta blight resistance in chickpea (Cicer arietinum L.) , as well as quantify the contribution of each QTL to observed phenotypic variation. Fifty-eight SSR markers and one morphological marker (flower color) were mapped on 83 F2 individuals and F2:3 families derived from the cross ICC 12004 (resistant) ´ Bivanij (susceptible local cultivar) at the International Center for Agricultural Research at Dry Area (ICARDA). The linkage map comprised eight linkage groups, excluding flower color which didn't assign to any linkage group. Area under disease progress curve (AUDPC) was used to evaluate the F2 population and F3 families. A fain's test based on means and variances of the ascochyta blight reaction of F3 families showed that a few genes segregated in the population. Using composite interval mapping, one and three genomic regions were detected, which were in association with leaf size and reaction to ascochyta blight, respectively. One QTL on LG7 accounted for 15% of phenotypic variation for leaf size. Furthermore, three QTLs on LG3, LG4 and LG6 accounted for 46.5% of the total estimated phenotypic variation for reaction to ascochyta blight. Fine mapping of the QTLs identified in this study would lead to the identification of markers that could be used for marker-assisted selection of chickpea genotypes with resistance to acochyta blight. These findings are particular pertinent considering that we used Ascochyta rabiei pathotype III and ICC 12004 (resistant to pathotype III) for the first time.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Chickpea
  • ascochyta blight
  • resistance
  • SSR
  • linkage map
  • QTL