شناسائی جدایه های قارچ Fusarium moniliforme عامل بیماری پوسیدگی طوقه برنج با استفاده از مارکرهای مولکولی RAPD

نویسنده

چکیده

در این بررسی ضمن جمع آوری 58 جدایه قارچ Fusarium moniliforme عامل بیماری پوسیدگی طوقه برنج، مشخصات مرفولوژیکی و بیماریزایی آن‌‌‌ها روی گیاه برنج در آزمایشگاه و گلخانه در مرکز تحقیقات بین المللی برنج (IRRI) مورد مطالعه قرار گرفت. بعلاوه با استفاده از روش( RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA به کمک پرایمر 11-J از کیت Operon با تواتر 5ACTCCTGCGA-3 قسمت‌های تصادفی از DNA هر جدایه تکثیر گردید. سپس جدایه‌‌‌ها به کمک تجزیه خوشه‌‌‌‌‌ ای با در نظر گرفتن 25 درصد تشابه گروه بندی شدند. نتایج به دست آمده نشان داد که جدایه ها از نظر میزان رشد چهار روزه کلنی در هشت گروه، از نظر تعداد روز تا رسیدن قطر کلنی به 90 میلی متر ( دیواره تشتک پتری) در یک گروه، از لحاظ ویژگی اثر گذاری روی میزان ارتقاع گیاه در پنج گروه و از نظر الگوی ژنتیکی در 13 گروه مختلف قرار می گیرند. بر اساس آزمون t درون گروه های مزبور از نظر خصوصیات اندازه گیری شده در آزمایشگاه و گلخانه، مشخص شد که هیچ کدام از جدایه ها در هیچ یک از خصوصیات با میانگین گروه مربوطه تفاوت معنی داری ندارند. بنابراین می توان نتیجه گیری نمود که با استفاده از مارکرهای مولکولی به روش RAPD می توان به جداسازی جدایه ها براساس مرفولوژیکی و بیماریزایی اقدام نمود. ضریب همبستگی (r=0.54) مثبت معنی داری بین میزان رشد کلنی قارچ در تشتک پتری و تأثیری گذاری قارچ بر ارتفاع بوته به دست آمد. بدین معنی که هر چه رشد قارچ در محیط کشت سریع تر بود موجب افزایش بیشتر ارتفاع گیاه گردید.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification of isolates of fusarium moniliforme, the causal agent of rice foot rot disease, using rapd technique

نویسنده [English]

  • M. Damadzadeh
چکیده [English]

In this study 58 isolates of Fusarium moniliforme which causes rice foot rot disease were collected from infected rice seeds. The morphological characteristics and pathogenicity of these isolates were determined in laboratory and greenhouse in the International Rice Research Institute (IRRI). Besides, by RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA) technique using primer J-11 from operon kit by sequences of "5-ACTCCTGCGA-3" the randomized portion of the DNA of each isolate was amplified. Using cluster analysis at 25% similarities, the isolates were classified as follows: from point of the growth rate of fungi after 4 days in Petri dishes into 8 groups from point of the number of days that fungi reached to the 90 mm diameter in one group from point of the effect of isolates on the length of seedlings into 5 groups from point of the genetical pattern into 13 groups. The characteristics measured in the laboratory or greehouse for each isolate did not significantly differ with the mean of each group using t-test analysis. Therefore, it could be concluded that molecular markers by RAPD technique can be used in differentiation of morpological and pathogenicity of Fusarium moniliforme isolates. The positive significant correlation coefficient (r=0.54) was observed between the growth rate of fungi in petri dishes and its effect on the length of seedling.

کلیدواژه‌ها [English]

  • rice
  • foot rot disease
  • Fusarium moniliforme
  • Isolates
  • RAPD